1986年3月17日、滋賀県・栗東市にて、藤岡家の長男として生を受けた佑介。父・健一は、当時、栗東・宇田明彦厩舎で調教助手を務めていたため、佑介はふたつ下の弟・康太とともに、いわゆる“トレ子(親が競馬関係者で、トレセンの近くで育った子)”として育った。幼いころから父を通じて馬と触れ合ってきた佑介は、馬が大好きな少年だった。そんな彼がジョッキーを目指したのは、ごく自然な流れだったのだろう。2004年3月、栗東・作田厩舎からデビュー。2002年11月に厩舎を開業していた健一だが、あえて自分の厩舎には所属させなかったという。

　早いもので、デビューから10年が経とうとしています。その間、良くも悪くもいろいろなことがあり、その都度、多くの人たちの支えや応援があって今の僕があるわけですが、一貫して持ち続けているのは、調教師であり、この世界の先輩でもある父(藤岡健一調教師)への感謝の気持ちです。

　昨年、フランス行きを決めた際も、いろいろと相談させていただきました。そして帰国後は、「よう行ってきたな。でも今からだぞ」と。僕がここから新しいスタートを切れるのも、素晴らしい師匠と巡り合えたこと、そしてここまで導いてくれた父のおかげだと思っています。

　初年度から35勝を挙げ、1999年デビューの北村宏司騎手以来5年ぶりとなるJRA賞最多新人騎手のタイトルを獲得。暮れの朝日杯フューチュリティSでは、新人にしてGI騎乗もはたした(サクセスドマーニ・13番人気13着)。翌2005年1月の京都牝馬Sでは、父の管理馬アズマサンダースを駆り、早くも重賞初制覇。2年目はさらに勝ち星を62勝まで伸ばし、以降、すっかり関西リーディングトップ10の常連となった。・・・